SEOUL NATIONAL UNIVERSITY HOSPITAL

24 июля 2024

 

Пациент с невыявленным редким заболеванием, найдено название болезни спустя 10 лет

 

Отечественная исследовательская группа успешно обнаружила название заболевания у пациента-подростка, прожившего без диагноза более 10 лет. Это стало возможным за счет создания новейшей методики анализа для выявления генетических мутаций при редких нейродегенеративных заболеваниях и последующего анализа редких заболеваниях на основе крупномасштабных статистических данных корейцев. 

 

Команда профессоров Чхэ Чжон Хи, Мун Чан Соп и Ли Сын Бок с кафедры клинической геномной медицины больницы Сеульского национального университета и профессора Чве Чон Мин с кафедры медицинских наук Корейского университета объявила 23 числа о том, что они проанализировали крупномасштабную информацию о геноме, зарегистрированную в группе Корейского биобанка, и пациентов, которые посещали больницу Сеульского национального университета в период с 2019 по 2023 год.

 

Нейрональная болезнь внутриядерных включений — нейродегенеративное заболевание, при котором аномальные белки (тельца включения) накапливаются в ядрах нервных клеток. Причиной заболевания является «мутация повтора короткой цепи», при которой последовательность оснований GGC аномально повторяется в гене NOTCH2NLC. В основном развивается в зрелом возрасте и сопровождается различными неврологическими симптомами, такими как лейкоэнцефалопатия, прогрессирующая когнитивная дисфункция и атаксия.

 

Однако существующее секвенирование следующего поколения с использованием коротких чтений, которое анализирует геном путем разделения его на короткие единицы, имело ограничения в выявлении паттернов повторов с короткой цепью. Таким образом, даже если появлялись результаты, подозрительные на болезнь нейрональных внутриядерных включений, поставить точный генетический диагноз было сложно.

Исследовательская группа разработала новейшую технику секвенирования, которая представила метод длинного чтения, который анализирует геном в длинных единицах для выявления мутаций повторов с короткой цепью. С использованием этого был проведен полногеномный анализ данных 90 пациентов с лейкоэнцефалопатией неизвестной этиологии, которые посетили больницу Сеульского национального университета и имели результаты визуализации болезни нейрональных внутриядерных включений.

 

В результате мутации короткоцепочечных повторов были подтверждены у 16 пациентов (17,8%). Другими словами, от 1 до 2 из 10 пациентов с лейкоэнцефалопатией неизвестной этиологии в Корее страдают редким заболеванием нейрональных внутриядерных включений. Исследовательская группа объяснила, что это подтверждает результаты предыдущих исследований о том, что это заболевание часто встречается у жителей Восточной Азии.

Кроме того, исследовательская группа проанализировала информацию о геноме (группа корейского биобанка) 3887 пациентов с редкими заболеваниями и их семей в Корее, чтобы определить распределение количества нуклеотидных повторов GGC в гене NOTCH2NLC, и начала определять количество повторов в гене NOTCH2NLC. Ядро нейрона начинается, когда эта нуклеотидная последовательность повторяется «более 65 раз». Было подтверждено, что это можно предположить как болезнь нейрональных внутриядерных включений. В результате применения этого стандарта у шести невыявленных нейродегенеративных пациентов, зарегистрированных в Корейском биобанке, впервые было предположительно диагностировано заболевание нейрональных внутриядерных включений.

 

Профессор Че сказал: «Результаты этого исследования демонстрируют важность анализа генома, основанного на крупномасштабных данных в диагностических исследованиях редких заболеваний». Также добавил: «Использование масштабных биологических данных, установленных на национальном уровне в качестве краеугольного камня, приведет к успеху на разработку новых методов диагностики и лечения редких заболеваний в будущем». «Ожидается, что мы сможем проводить расширенные исследования», — сказал он.